小兔子暗黑無限破

問題描述： 在將下載後的ImageJ資料夾搬到應用程式資料夾中後，程式可以使用但Plugin功能表下的項目消失。 系統資訊： OS Version: Mac OS 10.12 ImageJ: 1.51f  JAVA Version： 1.6.0_65 according to About ImageJ 1.8.0_111-b14 according to Control Panel Memory Assigned: 2854k of 7000MB ( No error message 原因： Mac OS 10.12為了解決使用者權限管理的漏洞，在執行應用程式時會建立一個隨機路徑的唯讀資料夾並把.app複製過去在其中執行(Gatekeeper Path Randomization)。這個作法會讓某些需要呼叫其他檔案的程式無法正常作用。 　 在ImageJ上，如果在Image>Show Info功能表(或Command + I)中的「ImageJ Home:」後面的路徑的開頭是"/private"，那就可能是Gatekeeper Path Randomization在作怪。 　 將執行檔從應用程式資料夾中複製到桌面(Option+拖曳)後刪掉原檔再把執行檔複製回去可以修正這個權限問題。 參考資料： Sierra and Gatekeeper Path Randomization Kind and timely support from Wayne Rasband (NIH/NIMH)

搞了有點久所以記錄一下。Mac OS自Yosemite開始不在系統裡內建X11，所以有些R的Package會無法運作，這個問題可以透過安裝 XQartz 來解決。 　 通常這個問題的錯誤訊息會是： Warning message : In doTryCatch ( return ( expr ), name , parentenv , handler ) : unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Resources/modules//R_X11.so' : dlopen (/ Library / Frameworks / R.framework / Resources / modules // R_X11.so , 6 ): Symbol not found : _CGBitmapContextCreate Referenced from : / Library / Frameworks / R.framework / Resources / modules // R_X11.so Expected in : flat namespace in / Library / Frameworks / R.framework / Resources / modules // R_X11.so 而這次我碰到的問題是在安裝新版的XQuartz(當時為2.7.9)時仍然在透過biocLite()指令安裝BioConductor上的Package時仍跳出這個訊息，執行的環境是Mac OS Sierra/RStudio 0.99.903/Microsoft R Open v3.3.1。嘗試過移除 R Studio、Microsoft R Open、還有XQuartz重新安裝都無法解決這個問題。 因為問題發生在Microsoft R Open在Mac OS Yosemite之後仍然指向錯誤的路徑來找X11，所以即使安裝了XQuartz也會因為路徑錯誤讓R誤判你沒有安裝，安裝回CRAN版的R之後就可以正常使用了。